Po určitej dobe procesu ochladzovania vzduchom musia byť žiarovo pozinkované oceľové rúry ihneď podrobené chladeniu vodou. Počas chladenia vzduchom teplota žiarovo pozinkovaných oceľových rúr pomaly klesá, čo umožňuje atómom zinku pokračovať v difúzii smerom k oceľovému substrátu a atómom železa pokračovať v difúzii smerom k vrstve zinku. V dôsledku toho sa vrstva čistého zinku postupne spotrebúva až do úplného vyčerpania. V tomto bode povrch žiarovo pozinkovanej oceľovej rúry už nebude mať svetlú vrstvu čistého zinku, ale namiesto toho bude pokrytý šedo-čiernou vrstvou zliatiny železa a zinku. Aby sa získala ako primerane hrubá vrstva zliatiny železa a zinku, tak aj lesklý povrch vrstvy čistého zinku, je potrebné zabrániť pokračujúcej difúzii atómov železa a zinku. Toto je dôvod na okamžité vykonanie vodného chladenia po stanovenom čase procesu.
Ďalšou výhodou vodného chladenia je zabránenie vstupu žiarovo pozinkovaných oceľových rúr s vysokými teplotami do pasivačného riešenia a ovplyvnenie jeho účinnosti. Teplota pasivačného roztoku by nemala presiahnuť približne 50 stupňov.
